Se han seleccionado cinco áreas geográficas prioritarias sobre la base de sus características oceanográficas, la importancia de sus ecosistemas y el impacto potencial de las actividades humanas:
- Banco Burdwood/Area protegida Namuncurá
- Talud Continental/Agujero Azul
- Golfo San Jorge
- Islas Georgias y Sandwich del Sur
- Sistema Marino del Rio de la Plata